По существующему мнению, является одним из основных инициаторов и непосредственных исполнителей по неофициальному внедрению в повседневную практику правоохранительных органов установки по уголовному преследованию лиц за политические убеждения по принципу – был бы человек, а статья всегда найдется.
Наиболее яркие примеры необходимости применения такой установки, были озвучены самим Бастрыкиным в разное время, например, в отношении Алексея Навального, которому было вменено причинение имущественного ущерба интересам ГУП «Кировлес» путем обмана или злоупотребления доверием при отсутствии признаков хищения, в бытность деятельности последнего в качестве советника губернатора Кировской области в 2009 году. При этом, Бастрыкин в свойственной ему манере публично давал разгон руководителю кировскому СКР, лицу, являющимся самостоятельным в уголовно-процессуальном плане, то есть уголовно-процессуальное законодательство РФ позволяет СКР мотивированно отменить постановления кировского СКР, если они не соответствуют Закону и обстоятельствам дела, но ни как не допускает давать какие-либо распоряжения и приказы на этот счет руководителю следственного органа.
Также, по результатам обыска у Ксении Собчак, когда были обнаружены и изъяты без всяких оснований, то есть другими словами попросту экспроприированы 1,5 млн.евро, Бастрыкин дал публичную и недвусмысленную команду следователям найти, не было ли в ее действиях сокрытия налогов от своей предпринимательской деятельности в особо крупном размере, что и будет, как следует полагать, через некоторое время найдено, если последней не удастся реабилитироваться перед властью.
В любом случае, в силу настолько демонстративного и выраженного во всех действиях Бастрыкина пренебрежения Законом, приходится расценивать их не как противозаконные, а исключительно как устрашающие.